若按校友会版排行榜看，武汉生物工程学院2018年全国排名第57位；2017年全国排名第53位；2016年全国排名第55位；2017年全国排名第47位；全国排名第36位；2013年全国排名第24位。以下是武汉生物工程学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 星级 | 所在地 | 类型 | 办学类型 | 办学层次 |
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| 2018 | 57 | 武汉生物工程学院 | 4 | 湖北 |
| 应用型 | 中国高水平民办大学 |
| 2017 | 53 | 武汉生物工程学院 | 3 | 湖北 | 理工 | 应用型 | 中国知名民办大学 |
| 2016 | 55 | 武汉生物工程学院 | 3 | 湖北 |
| 应用型 | 中国知名民办大学 |
| 2015 | 47 | 武汉生物工程学院 | 3 | 湖北 | 理工 | 应用型 | 中国知名民办大学 |
| 2014 | 36 | 武汉生物工程学院 | 3 | 湖北 |
| 应用型 | 中国知名民办大学 |
| 2013 | 24 | 武汉生物工程学院 |
| 湖北 |
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若按金平果版排行榜看，武汉生物工程学院2018年全国本科院校排名第703位；2017年全国本科院校排名第708位；2016年全国本科院校排名第680位；2017年全国本科院校排名第636位。以下是武汉生物工程学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 所在地 | 省排名 |
|---|
| 2018 | 703 | 武汉生物工程学院 | 湖北 | 35 |
| 2017 | 708 | 武汉生物工程学院 | 湖北 | 35 |
| 2016 | 680 | 武汉生物工程学院 | 湖北 | 33 |
| 2015 | 636 | 武汉生物工程学院 | 湖北 | 32 |
2017年武汉生物工程学院在各省的录取分数线详情
| 招生省份 | 录取批次 | 科类 | 最低分 |
| 汉语言理科 |
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| 新疆 | 二本 | 汉语言理科 | 370 |
| 汉语言文科 |
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| 新疆 | 二本 | 汉语言文科 | 388 |
| 理科 |
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| 安徽 | 二本 | 理科 | 437 |
| 福建 | 二本 | 理科 | 358 |
| 甘肃 | 三本 | 理科 | 391 |
| 广东 | 二本 | 理科 | 409 |
| 广西 | 二本 | 理科 | 351 |
| 贵州 | 二本 | 理科 | 378 |
| 海南 | 本科B | 理科 | 525 |
| 河北 | 二本 | 理科 | 428 |
| 河南 | 二本 | 理科 | 409 |
| 黑龙江 | 三本A | 理科 | 353 |
| 湖南 | 二本 | 理科 | 430 |
| 江苏 | 二本 | 理科 | 290 |
| 江西 | 二本 | 理科 | 451 |
| 宁夏 | 三本 | 理科 | 375 |
| 山东 | 本科 | 理科 | 472 |
| 山西 | 二本C | 理科 | 375 |
| 陕西 | 三本 | 理科 | 383 |
| 四川 | 二本 | 理科 | 468 |
| 云南 | 二本 | 理科 | 413 |
| 重庆 | 二本 | 理科 | 436 |
| 文科 |
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| 安徽 | 二本 | 文科 | 466 |
| 福建 | 二本 | 文科 | 387 |
| 甘肃 | 三本 | 文科 | 423 |
| 广东 | 二本 | 文科 | 434 |
| 广东 | 一本 | 文科 | 434 |
| 广西 | 二本 | 文科 | 417 |
| 贵州 | 二本 | 文科 | 454 |
| 海南 | 本科B | 文科 | 557 |
| 河北 | 二本 | 文科 | 433 |
| 河南 | 二本 | 文科 | 436 |
| 黑龙江 | 三本A | 文科 | 387 |
| 湖南 | 二本 | 文科 | 485 |
| 江苏 | 二本 | 文科 | 290 |
| 江西 | 二本 | 文科 | 473 |
| 宁夏 | 三本 | 文科 | 451 |
| 山东 | 本科 | 文科 | 492 |
| 山西 | 二本C | 文科 | 416 |
| 陕西 | 三本 | 文科 | 392 |
| 四川 | 二本 | 文科 | 479 |
| 云南 | 二本 | 文科 | 459 |
| 重庆 | 二本 | 文科 | 447 |
| 未分科 |
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| 浙江 | 二段 | 未分科 | 480 |